Sykdommen borreliose har fått mye oppmerksomhet de senere årene. Borreliose kommer av infeksjoner av bakterien borrelia burgdorferi som overføres av skogflåtten, ixodes ricinus, og kan være alvorlig for den som rammes.
Også husdyr får overført smittestoffer fra skogflåtten. Noen eksempler er bakterien anaplasma phagocytophilum, som gir sykdommen sjodogg hos sauelam, og den encellede organismen babesia divergens, som gir sykdommen «blodpiss» hos storfe.